Las Instituciones académicas conservan un legado especial en información y documentación, donde encontramos diversas anécdotas y hechos trascendentales a nivel institucional. El Archivo Histórico es el Centro de Memoria de la Universidad Javeriana y funciona como una unidad administrativa con objetivos académicos adscrita a la Secretaría General de la Pontificia Universidad Javeriana. Lleva el nombre de Juan Manuel Pacheco, S.J., en reconocimiento al investigador javeriano e historiador de la Compañía de Jesús en Colombia. Sus documentos personales, manuscritos y publicaciones, fichas de estudio, fotografías de su archivo personal entre otros, dan lugar a la creación del Archivo Histórico Javeriano en el año 1996.
